辣椒CaNRAMP基因家族的鑒定與表達分析.pdf

為了初步研究辣椒(Capsicum annuum L.)NRAMP家族基因在重金屬鎘脅迫下的表達情況,通過生物信息學方法從辣椒基因組中鑒定出NRAMP基因,并對這些基因的序列結構、系統(tǒng)進化樹、表達譜等進行系統(tǒng)分析。結果表明,辣椒中含有5個具有典型NRAMP結構域的基因,根據其在染色體上的位置,分別將其命名為CaNRAMP1CaNRAMP5,根據系統(tǒng)進化分析,將辣椒的NRAMP基因分為2類,類包含2個基因(CaNRAMP1、CaNRAMP3),分別含有10、12個內含子,類包含3個基因(CaNRAMP2、CaNRAMP4、CaNRAMP5),均含有3個內含子。基于基因組織表達模式的分析結果表明,CaNRAMP1在不同組織中均未檢測到其表達;CaNRAMP5的表達集中在花器官,其余CaNRAMP基因均有不同的表達模式;通過逆轉錄定量PCR(qRT-PCR)分析發(fā)現(xiàn),辣椒苗期中的葉片經過鎘處理后,CaNRAMP3基因呈明顯上調的趨勢,參與鎘脅迫反應的正向調控,其他基因則不參與鎘脅迫反應的調控。研究結果為進一步分析辣椒NRAMP基因家族的功能奠定了基礎。