辣椒CaNRAMP基因家族的鑒定與表達(dá)分析.pdf

為了初步研究辣椒(Capsicum annuum L.)NRAMP家族基因在重金屬鎘脅迫下的表達(dá)情況,通過生物信息學(xué)方法從辣椒基因組中鑒定出NRAMP基因,并對(duì)這些基因的序列結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化樹、表達(dá)譜等進(jìn)行系統(tǒng)分析。結(jié)果表明,辣椒中含有5個(gè)具有典型NRAMP結(jié)構(gòu)域的基因,根據(jù)其在染色體上的位置,分別將其命名為CaNRAMP1CaNRAMP5,根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化分析,將辣椒的NRAMP基因分為2類,類包含2個(gè)基因(CaNRAMP1、CaNRAMP3),分別含有10、12個(gè)內(nèi)含子,類包含3個(gè)基因(CaNRAMP2、CaNRAMP4、CaNRAMP5),均含有3個(gè)內(nèi)含子。基于基因組織表達(dá)模式的分析結(jié)果表明,CaNRAMP1在不同組織中均未檢測到其表達(dá);CaNRAMP5的表達(dá)集中在花器官,其余CaNRAMP基因均有不同的表達(dá)模式;通過逆轉(zhuǎn)錄定量PCR(qRT-PCR)分析發(fā)現(xiàn),辣椒苗期中的葉片經(jīng)過鎘處理后,CaNRAMP3基因呈明顯上調(diào)的趨勢,參與鎘脅迫反應(yīng)的正向調(diào)控,其他基因則不參與鎘脅迫反應(yīng)的調(diào)控。研究結(jié)果為進(jìn)一步分析辣椒NRAMP基因家族的功能奠定了基礎(chǔ)。