番茄（Solanum lycopersicum）SlGLR基因家族的生物信息學分析.pdf

本研究通過對番茄高質量全基因組序列同源搜索分析,找到番茄中共有13個SlGLRs家族成員。并利用生物信息學方法詳細分析了該家族所有成員的基因結構、蛋白結構域、進化關系。結果顯示:番茄SlGLR家族的13個成員均含有57個外顯子,各個成員都包含IPR001828、IPR001320和IPR001638這三個結構域,整個家族可分為三個亞家族,且SlGLR亞家族各成員,除了SlGLR2.6以外均成簇分布在6號染色體上。不同激素處理下的表達分析顯示該家族不同成員對不同激素處理的響應不同;組織表達分析表明SlGLR3.2在番茄的果實中特異高表達,暗示其在果實發(fā)育中可能起著重要作用。為了進一步分析其功能,我們對SlGLR3.2的理化性質、親水性/疏水性、跨膜區(qū)、亞細胞定位、蛋白二級結構進行了詳細分析。結果表明SlGLR3.2為親水性膜蛋白,含有三個跨膜區(qū),二級結構主要由-螺旋、延伸鏈、-轉角、無規(guī)則卷曲組成。本研究將為進一步研究番茄SlGLRs的功能提供參考依據(jù)。