NY T 4491-2025 番茄種子產(chǎn)地檢疫規(guī)程.pdf

2025 01 09 發(fā)布 2025 05 01 實施 番茄品種鑒定 SNP分子標記法 05 中華人民共和國農(nóng)業(yè)行業(yè)標準 備案號 XXXX XXXX 65 020 01 CCS B 4493 2025 Identification of tomatovarieties SNP marker method 中華人民共和國農(nóng)業(yè)農(nóng)村部 發(fā)布 NY T 目 次 前言 范圍 規(guī)范性引用文件 術(shù)語和定義 縮略語 原理 主要儀器設(shè)備及試劑 溶液配制 引物信息及使用 參照品種及使用 操作程序 結(jié)果判定與表述 附錄A 規(guī)范性 主要儀器設(shè)備及試劑 附錄B 規(guī)范性 溶液配制 附錄C 資料性 引物序列及分型等信息 NY T 前 言 本文件按照GB T 標準化工作導(dǎo)則 第 部分 標準化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則 的規(guī)定起 草 請注意本文件的某些內(nèi)容有可能涉及專利 本文件的發(fā)布機構(gòu)不應(yīng)承擔(dān)識別這些專利的責(zé)任 本文件由農(nóng)業(yè)農(nóng)村部種業(yè)管理司提出 本文件由全國植物新品種測試標準化技術(shù)委員會 SAC TC 歸口 本文件起草單位 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技發(fā)展中心 北京通州國際種業(yè)科技有限公司 北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬 菜研究所 本文件主要起草人 韓瑞璽 王均帥 霍秀愛 張建 馬瑩雪 劉迎春 劉寶安 張凱淅 張秀杰 王晨宇 溫常龍 唐浩 馮艷芳 李嬡嬡 黃芳 王銘堂 劉雪景 龐雪兵 NY T 番茄品種鑒定 SNP分子標記法 范圍 本文件規(guī)定了利用單核苷酸多態(tài)性 SNP 標記進行番茄 SolanumLycopersicumL 品種鑒定的術(shù) 語和定義 縮略語 原理 主要儀器設(shè)備及試劑 溶液配制 引物信息及使用 參照品種及使用 操作程序 結(jié) 果判定與表述 本文件適用于番茄品種DNA分子數(shù)據(jù)采集和品種鑒定 規(guī)范性引用文件 下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款 其中 注日期的引用文件 僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件 不注日期的引用文件 其最新版本 包括所有的修改單 適用于本文件 GB T 農(nóng)作物種子檢驗規(guī)程 扦樣 GB T 分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法 NY T 植物品種鑒定 DNA分子標記法 總則 術(shù)語和定義 NY T 界定的術(shù)語和定義適用于本文件 縮略語 下列縮略語適用于本文件 CTAB 十六烷基三甲基溴化銨 cetyltrimethylammoniumbromide DNA 脫氧核糖核酸 deoxyribonucleicacid EDTA 乙二胺四乙酸 ethylenediaminetetraaceticacid KASP 競爭性等位基因特異性PCR kompetitiveallelespecificPCR PCR 聚合酶鏈式反應(yīng) polymerasechainreaction SNP 單核苷酸多態(tài)性 singlenucleotidepolymorphism Taq酶 耐熱DNA聚合酶 Taq DNApolymerase TE 三羥甲基氨基甲烷乙二胺四乙酸 Tris EDTA Tris 三羥甲基氨基甲烷 Tris hydroxymethyl methylaminomethaneTHAM 原理 番茄品種的基因組中存在著能夠世代穩(wěn)定遺傳的SNP位點 不同番茄品種在同一SNP位點的序列 可能存在差異 這種差異可通過PCR擴增 測序 高分辨率熔解曲線法 基因芯片等方法進行檢測 進而區(qū) 分不同的品種 本文件推薦了基于KASP技術(shù)的熒光原位掃描檢測方法 主要儀器設(shè)備及試劑 主要儀器設(shè)備及試劑見附錄A 溶液配制 除非另有說明 在分析中僅使用確認為分析純的試劑和符合GB T 規(guī)定的一級水 溶液配制方 法見附錄B NY T 引物信息及使用 引物序列及分型等信息見附錄C 可利用附錄C中的引物序貫檢測 當檢測到的差異位點數(shù)能判定 送檢樣品與對照樣品不同時 停止檢測 參照品種及使用 參照品種用于輔助確定送檢樣品在某個位點的等位變異 宜與送檢樣品同時檢測 操作程序 樣品準備 送檢樣品可為種子 幼苗 葉片等組織或器官 種子樣品需扦樣時 應(yīng)符合GB T 的規(guī)定 每 份樣品不少于 個個體 等量混合分析 必要時進行個體檢測 DNA提取 取混合樣本約 mg 置于 mL圓底離心管中 經(jīng)液氮冷凍后充分研磨 每管加入 L預(yù)熱 到 的CTAB提取液 充分混合 水浴 min min 每隔 min輕緩顛倒混勻一次 每管 加入與CTAB提取液等體積的三氯甲烷和異戊醇混合液 輕緩混勻后靜置 min rpm離心 min 吸取上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中 加入等體積預(yù)冷的異丙醇 輕輕顛倒混勻 放置 min rpm離心 min 棄上清液 用體積分數(shù)為 的乙醇溶液洗滌 遍 晾干 加入 L雙蒸水 或TE緩沖液充分溶解 檢測DNA濃度和質(zhì)量 備用 注 以上為推薦的DNA提取方法 DNA質(zhì)量能夠滿足PCR擴增要求的其他DNA提取方法均適用于本標準 DNA 溶液的紫外吸光度OD 與OD 的比值宜介于 之間 注 三氯甲烷和異戊醇混合液中三氯甲烷與異戊醇的體積比為 SNP基因分型 PCR擴增 反應(yīng)體系 PCR反應(yīng)可以在不同規(guī)格的PCR板或膜上進行 反應(yīng)體系的總體積和各組分體積按照表 進行配 制 設(shè)置 個空白對照和 個參照樣品 表 基于微孔板或微量反應(yīng)孔膜平臺的PCR反應(yīng)體系 微孔板類型 微孔板 L 微孔板 L 微量反應(yīng)孔膜 L DNA模板 ng L PCRMIX 引物工作液 雙蒸水 總反應(yīng)體積 注 微量反應(yīng)孔膜為DouglasArrayTape平臺的反應(yīng)體系 微孔板的反應(yīng)體系參照微量反應(yīng)孔膜配制 反應(yīng)程序 a min b s s 次循環(huán) c 若初始反應(yīng)結(jié)束檢測不到熒光信號 可繼續(xù) s s 次 次循環(huán) 熒光原位掃描 利用熒光原位掃描系統(tǒng)對PCR擴增產(chǎn)物進行基因分型 空白對照沒有擴增信號或者擴增信號較弱 NY T 且參照品種等位變異與附錄C的等位變異一致時 采集基因分型數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)記錄 數(shù)據(jù)記錄方式用SNP位點堿基符號表示基因型 如AA TT CC或GG 缺失數(shù)據(jù)記錄為 數(shù) 據(jù)質(zhì)量需符合對應(yīng)檢測平臺的質(zhì)控要求 數(shù)據(jù)比對及差異位點統(tǒng)計 逐一比對送檢樣品與對照樣品每個位點的等位變異數(shù)據(jù) 按照位點相同 位點差異 數(shù)據(jù)缺失 無法判 定情形記錄每個位點的比對結(jié)果 統(tǒng)計檢測位點數(shù)和差異位點數(shù) 結(jié)果判定與表述 判定規(guī)則 當差異位點數(shù)大于 判定為 不同 當差異位點數(shù)小于等于 判定為 疑同 結(jié)果表述 送檢樣品與對照樣品 或?qū)φ諛悠分讣y 采用熒光原位掃描檢測 檢測位點數(shù)為 差異位點數(shù)為 判定為 NY T 附 錄 A 規(guī)范性 主要儀器設(shè)備及試劑 A 主要儀器設(shè)備 A 高速冷凍離心機 轉(zhuǎn)速不低于 rpm A 微量移液工作站或微量移液器 A 水浴鍋或干式恒溫金屬浴 A 紫外分光光度計 波長定點掃描 nm nm和 nm A 組織研磨儀 A 分析天平 感量為 g A pH計 A 渦旋混合器 A 高壓滅菌鍋 A PCR擴增儀或水浴PCR擴增裝置 A 熒光原位掃描系統(tǒng) 色及以上熒光 A 低溫冰箱 A 主要試劑 A 十六烷基三甲基溴化銨 C H CH NBr CAS號 A 三氯甲烷 CHCl CAS號 A 異戊醇 C H O CAS號 A 異丙醇 C H O CAS號 A 乙二胺四乙酸二鈉 C H N Na O CAS號 A 三羥甲基氨基甲烷 NH C CH OH CAS號 A 氫氧化鈉 NaOH CAS號 A 氯化鈉 NaCl CAS號 A 無水乙醇 CH CH OH CAS號 A 鹽酸 HCl CAS號 A 巰基乙醇 C H OS CAS號 A 聚乙烯吡咯烷酮 C H NO n CAS號 NY T 附 錄 B 規(guī)范性 溶液配制 B DNA提取 B mol LEDTA溶液 稱取 g乙二胺四乙酸二鈉溶于 mL水中 加NaOH調(diào)pH至 加水定容至 mL 高壓滅菌 min B mol LTris HCl溶液 稱取 g三羥甲基氨基甲烷溶于 mL水中 加HCl調(diào)pH至 加水定容至 mL 高壓滅菌 min B CTAB提取液 分別稱取 gCTAB和 g氯化鈉和 g聚乙烯吡咯烷酮溶于約 mL水中 加入 mL mol LTris HCl溶液 mL mol LEDTA溶液 加水定容至 mL 高壓滅菌 min 冷卻后加入 mL 巰基乙醇 搖勻備用 B TE緩沖液 分別量取 mL mol LTris HCl溶液和 mL mol LEDTA溶液 加水定容至 mL 高壓滅菌 min B KASP引物工作液 將附錄C所示每個位點的三管引物干粉分別用水溶解至 mol L 條上游引物和 條下游通用 引物分別取 L L L混合 再補 L水 最終 條上游引物 條下游通用引物終濃度分別 為 mol L mol L mol L NY T 附 錄 C 資 料 性 引 物 序 列 及 分 型 等 信 息 表 C 列 出 了 個 SN P 引 物 序 列 及 分 型 等 信 息 表 C 引 物 序 列 及 分 型 等 信 息 位 點 編 號 引 物 名 稱 染 色 體 等 位 變 異 等 位 變 異 參 照 品 種 吉 麗 千 禧 引 物 序 列 側(cè) 翼 序 列 SN P G A GA GG FA M G GG AT TT CA GA GA GA TC AA AA CT TA T HE X GG GA TT TC AG AG AG AT CA AA AC TT AC Co mm on G AA CT TT AT GC CT TC TT CT GT GC TT CT CT TT TA AG AA GC TT CC AT GG AA CT TT AT GC CT TC TT C TG TG CA TC T A G TA AG TT TT GA TC TC TC TG AA AT CC CT GA TT AC AG AT CT CA CA TA CG TA TC SN P T C TC TT FA M T TG AA AG GT GA TT GA GG AA CG HE X TT TG AA AG GT GA TT GA GG AA CA Co mm on C AT TT TA CT CT TC TA TT CG CC TG A CT CC AA AC AC CC AT TT TA CT CT TC TA TT CG CC TG AA TC AC CA CC AG CA GC T C G TT CC TC AA TC AC CT TT CA AA AC CC AT CG GA GA AA CA AC CA AC TC AC AA C SN P A G AA AG FA M A GA TC AA GG TC TC TC AA GG AA GC HE X CA GA TC AA GG TC TC TC AA GG AA GT Co mm on C TT GA CC CA CC AA AA GG AG G TG GT TA GG GA AA GA GG TA CT TG AC CC AC CA AA AG GA GG GA C TC CT TG AC T A G C TT CC TT GA GA GA CC TT GA TC TG AA GC T CA GG AA GA AT CA TT TG CT TC TG SN P A G AG GG FA M C AT AG GA GG GG AC AC CA TA GC HE X CC AT AG GA GG GG AC AC CA TA GT Co mm on T CT CT CG GT CG GT AA AA CC AT AC AG AA CC AA AA TT AA CC GT TC TC TC GG TC GG TA AA AC CA T AC CT GT CA T A G C TA TG GT GT CC CC TC CT AT GG GG GG AT GA TA AA GG GT GG AC AT TA CT TT G SN P G A GA GG FA M C CA CC AA GG AC TA TA AG CA AA AG T HE X CA CC AA GG AC TA TA AG CA AA AG C Co mm on T GG CG AG GA AT CA GT GC A AC CA TT AC AA AC AC AA TT GC TG GC GA GG AA TC AG TG CA CA A AC TG GC TT C A G C TT TT GC TT AT AG TC CT TG GT GG TA GT TA TA TC AT CT TG TT TC TT TG CG G SN P T C TC TC FA M G AG GC AG AG GA GT GG AA AC GC HE X GA GG CA GA GG AG TG GA AA CG T Co mm on G AG CA TT CT TT GC TT CC TT GG CA GC CA AA GA GC AA GC TG AA TC TG CT CA AG AG GA GG CA GA GG A GT GG AA AC G T C AA GT AC GG CA TT GC TG CC AA GG AA G CA AA GA AT GC TC TT GA GA AG GC AG C SN P T C TT CC FA M G AT TG TG GA TT AA GG AA TT TT GG TG C HE X GA TT GT GG AT TA AG GA AT TT TG GT GT Co mm on C CA AT TA TT CC CA TC CA TT TC AA CT AT CG AA GC CA GA AA TT GT GA TT AT TG AT TG TG GA TT AA GG AA TT TT GG TG T C G GA GT TG AA AT GG AT GG GA AT AA TT G GA GG GC CG CT CA GG CT CA GG CT CC NY T 表 C 續(xù) 位 點 編 號 引 物 名 稱 染 色 體 等 位 變 異 等 位 變 異 參 照 品 種 吉 麗 千 禧 引 物 序 列 側(cè) 翼 序 列 SN P T C TC TT FA M A GC CG CA GA GG TA GT AG TT CC HE X CA GC CG CA GA GG TA GT AG TT CT Co mm on G TT GC CG CT TC TC AT CT CC TC TA TT CC GG TA AG AG AG AT CC GA TG GA TC AG CC GC AG A G GT AG TA GT TC T C G TC GG AG AC TG TG TC AG CG AG GA GT CG AG GG AG AT GA GA AG CG GC AA CG G SN P A G AG AA FA M T TC AA CA CG AA CC TA GT AA TA GT CA TC HE X TT CA AC AC GA AC CT AG TA AT AG TC AT T Co mm on C AG CA GA TG CT CA TC GG AC T GA AG AA AG CA GA GC GA TG GA TC AC GC AG CA GA TG CT CA TC G GA CT GA TT T A G A TG AC TA TT AC TA GG TT CG TG TT GA AT GA AC AG AG TA AA TA CC CT GA AT C SN P A G GG AA FA M C GT GA GG TG AA GG AA CC TC TG HE X TC GT GA GG TG AA GG AA CC TC TA Co mm on T CA GC TT GA GT GG TG AT GG C TT CG GG TG TA TC CT CT AG CT AA GA CG GA TC GT GA GG TG AA G GA AC CT CT A G TT CC AA AT GT CC CA AG CC AT CA CC AC T CA AG CT GA AA AC AT TA CG GC AC A SN P C G CG CC FA M G GA TC CA TT CA TT CA TC AC AT TA TA G HE X GG AT CC AT TC AT TC AT CA CA TT AT AC Co mm on C TT AA GA TG TT CA CA AA GA CT AA AT GG CA CA AA CT TA TA GA TA TC AT AT AA GG AT CC AT TC AT TC AT C AC AT TA TA C G TA AT AA CC CA TT TA GT CT TT GT GA AC A TC TT AA GA TA AC AC GC AA TT CA A SN P A T AA AA FA M A TT TC TA AC TC GT GC TT GC TC AT T HE X AT TT CT AA CT CG TG CT TG CT CA TA Co mm on T CT AA AA AT GA CC CA AC TC AC AA TC CG AT AG AG TT CA TC TT TA TG CA AT TT AT TT CT AA CT CG TG C TT GC TC AT A T AC CG AT TG TG AG TT GG GT CA TT TT TA G AG TG CT TT CA TG GG CA TT TG TT T SN P G A GG GG FA M A CC TC TG AG TG AC AC TT CC AA TT HE X AC CT CT GA GT GA CA CT TC CA AT C Co mm on A CA CT GA TA AC CC AG AG CC TT C GT GG AA TA GC CA GA AG AT AC AC TG AT AA CC CA GA GC CT TC A GT GC TG TT T A G AT TG GA AG TG TC AC TC AG AG GT CA CA AA CT GC TT GT GT TG TC GG AT CC AA SN P T C TT CC FA M C AC AG CT TT CG TC AT CT CC G HE X TC AC AG CT TT CG TC AT CT CC A Co mm on A GA AC TA TA TC TA AA GA GG AA AT GT TG C CA AG TA CA TA GA AC TA TA TC TA AA GA GG AA AT GT TG CA CC TT TT TG AA TT T C GG AG AT GA CG AA AG CT GT GA TA TA C CT CT GG AA TT GA AG CA AG TT AG AG A SN P T C TC TC FA M A TC GT CT GG AT TA AG GC TA AG G HE X AA TC GT CT GG AT TA AG GC TA AG A Co mm on G GG CT AT CA AG TG TT AT CA GA GA G GC TC GA GT AG CT GT CG AC TC TC AG AG GG CT AT CA AG TG TT A TC AG AG AG C T C C TT AG CC TT AA TC CA GA CG AT TC AA TT GC TG GG GA AG CA GT TT GT GA TA T SN P T G TG TT FA M A TG CC GA AT AT AC TT CC TA TT AC G HE X AC AT GC CG AA TA TA CT TC CT AT TA CT Co mm on G GT CC AT GT CA TC AT TT TA TC CT A CT AG TC TA GA TC CG TT TC TA CA TG TG TA CT AA AT TA CA TG C CG AA TA TA CT TC CT AT TA C T G TG TA GG AT AA AA TG AT GA CA TG GA CC AT GA CA AA GC TC AT CT TT AT GT CA AA AA CA T TT G NY T 表 C 續(xù) 位 點 編 號 引 物 名 稱 染 色 體 等 位 變 異 等 位 變 異 參 照 品 種 吉 麗 千 禧 引 物 序 列 側(cè) 翼 序 列 SN P C G GG CG FA M C GG TC GA GT TC GG AG AC AT AC HE X CG GT CG AG TT CG GA GA CA TA G Co mm on A GG TT TC TC TT TC TC CG TC CC GG TG AA GG TT TC TC TT TC TC CG TC CC TT CC CG CG CT GC CG CT AA CC AA CT C G T AT GT CT CC GA AC TC GA CC GC AT TG TT CT CA AA GA CA AA TC AT CG GC TC G SN P A G AA AA FA M T GA GT AA AA CA TC GA CT TT TG CG HE X TG AG TA AA AC AT CG AC TT TT GC A Co mm on G CA GC AA TG CT AA AG GA AA TC GT AG TT GT TG TT GT TG TT GG AG AG CC TT TG AG TA AA AC AT C GA CT TT TG C A G TA TT CT TC TC TT TC AT GT TT GA TT TC CT TT AG CA TT GC TG CA AC AT CT TT SN P T C TC CC FA M T CG CA AT TT AG CA CT TG GT AA G HE X TC GC AA TT TA GC AC TT GG TA AA Co mm on C TT GG GT AT GC AC CT TT TC G AA AA AC CC AT AC CC AT CT GA AT TA CT CA AC TT GG GT AT GC A CC TT TT CG G T C T TA CC AA GT GC TA AA TT GC GA TA TG AG TA AG GA GT AC TA CC AA AA CC GG G SN P A G GG GG FA M G TG GA GA AA TC TT TT GC AC CC HE X TG TG GA GA AA TC TT TT GC AC CT Co mm on T AC TT CC CC CT CC CA CG TT TC TG GT GG CT TC CC AT TA CT TC CC CC TC CC AC GT TA TC AG GA AA AC TC TT A G GG TG CA AA AG AT TT CT CC AC AA CC AC T TC TT CT TC AT TC TC TT GT AA CA A SN P A G GG AA FA M T GT AG GG AT TA CT CT CT GT AT GG AA C HE X TG TA GG GA TT AC TC TC TG TA TG GA AT Co mm on C CC TG GG AA GT CT TT CA AT GT TG AT CA AC CT TT CA CC CC TG GG AA GT CT TT CA AT GT GT TG C AG AC AT TT G A G TT CC AT AC AG AG AG TA AT CC CT AC AA AT GC TG AT AG AA GT AA TC TT GG GC SN P A G AG AA FA M T TT TC CC TC AT AA AG TT TC AA TC TC HE X TT TT CC CT CA TA AA GT TT CA AT CT T Co mm on T GA AT TA AG CT CA GA GT CA AA GA AA CT AT CT TG AA TT AA GC TC AG AG TC AA AG AA AA AT TC TA TT G AT TC AC TT G A G A GA TT GA AA CT TT AT GA GG GA AA AA TA CA GA GA TC CA AA AA TA GC AA GG T SN P T C TC CC FA M A AC GT CA AT GG CG TC CC G HE X AA CG TC AA TG GC GT CC CA Co mm on T TC TT AC TT CT TC AA TA AA CC TC AG GA AA CG AT AA TC TT CT TA CT TC TT CA AT AA AC CT CA GG AA TT C TT TG GA GA A T C GG GA CG CC AT TG AC GT TG AT TC CG AT GA TG AT AG CC AT GG CT CC TT GA AT SN P T G TT TG FA M C CT TC AA GA TT TT CA TT CC TC TG HE X TC CT TC AA GA TT TT CA TT CC TC TT Co mm on T CA TT AT GT AA AG AA TC CT CA GC AC AG TC TC TT CG TT TG CC TC AG CA CT TG AT CC TT CA AG AT TT TC AT TC CT CT T G T TC CA CA AG GG AT TG TG CT GA GG AT TC T TT AC AT AA TG AA GG CA TA TA AG SN P A C AC CC FA M A CA TA TT CA CA GT CC AA TT TG TC TT G HE X AC AT AT TC AC AG TC CA AT TT GT CT TT Co mm on A AA TA AG CT TT GC CA TT GT AA GA GA AC TC CA AG GG AC CA AA TA AG CT TT GC CA TT GT AA GA GA TA A GA TC AT GT C A C AA GA CA AA TT GG AC TG TG AA TA TG T TC TT AG AC TG CG AA CG GC GT AA CT T NY T 表 C 續(xù) 位 點 編 號 引 物 名 稱 染 色 體 等 位 變 異 等 位 變 異 參 照 品 種 吉 麗 千 禧 引 物 序 列 側(cè) 翼 序 列 SN P T C CC CC FA M T TC TT GA AT CA CT AA AT GC AC CC HE X AA TT CT TG AA TC AC TA AA TG CA CC T Co mm on A GT TA CA GA TT CT CC TA CT TT CT TA TT CA AG AT TT TG AA GT TC AC CC AA CT CT TC AA TT CT TG AA TC AC T AA AT GC AC C T C AC GA CA AA TC TT GT TG AA TA AG AA AG TA GG AG AA TC TG TA AC TT GC TT TT SN P T C TC TT FA M G TT AC TG AG TT GC AT TA TG AA GA TA TT G HE X TG TT AC TG AG TT GC AT TA TG AA GA TA TT A Co mm on A AC AA CA GG GT TG CT AA CA TT TT TG GG CA AT AA AC TT GA TC AA TA AC AA CA GG GT TG CT AA CA T TT TG GA CA A T C AA TA TC TT CA TA AT GC AA CT CA GT AA CA AC AC CT TG AT GT GA AG CT GG CC SN P A G AG AA FA M T TT CC TC AT TC TC GA TC TC CG HE X GT TT CC TC AT TC TC GA TC TC CA Co mm on A TG GA CG AA AG AA AG AG AA AA AG A TT GG GA CA TG AG AT CA TC CA AA TG CT TT TG TT TC CT CA TT C TC GA TC TC C A G AG CT GA TT CA CG AT TC GA TA TC AT TC T TT TT CT CT TT CT TT CG TC CA TC A SN P A G AG GG FA M T AT CA GG CC TT GG TC TA GA TG G HE X TT AT CA GG CC TT GG TC TA GA TG A Co mm on T AA CT CG CC AA TT GC AA CA CT TA AC CT TG CG GA AT TT GG TG AA AT TT CC TT AT CA GG CC TT G GT CT AG AT G A G A AT AT TT AA GG CC GG CA GT GT TG CA AT TG GC GA GT TA TT AT AG GG CT TG T SN P A T AT AA FA M G CA GC GA CC TG AC TT CA AA AA T HE X GC AG CG AC CT GA CT TC AA AA AA Co mm on G TT AT CC CC AG AT CT AG CT AT AT AG T GA AA CA TT TT TA AA GT GA GG TC AT AT AA TG CA GC GA CC TG A CT TC AA AA A A T GT TG TT GA TT CT AA AT CT GT AT TA C TA TA TA GC TA GA TC TG GG GA TA AC A SN P T C TC TT FA M T GA TG GT TC AA GT TC CA AT CA C HE X TT GA TG GT TC AA GT TC CA AT CA T Co mm on A AT AA TT TG TT GG TC TT TC AT GA TG TA TT CT CT AA GT AA GT TA GA AG TA GA CA CC GG AC TC TT TG A TG GT TC AA GT TC CA AT CA T C GG GG TT GC TA GC AG TG T TC AT CA TG AA AG AC CA AC AA AT TA TT TG GA CC SN P A C AA AA FA M A AT GC TA GG CC AA TA TA AA TC AA AC HE X AA TG CT AG GC CA AT AT AA AT CA AA A Co mm on C AT AT GG TA AC TT GC AG GG AG C CA AT GC CG TT GT AG AA CT GT TG CT GA AA TG CT AG GC CA AT A TA AA TC AA A A C GA CC GG AC TG CT CC CT GC AA GT TA CC AT AT GC TG AT GA AT CC TT AT AG AA SN P C A CC CC FA M T TC TT TA AC AA GG TA AA CT AT GA GG A HE X TC TT TA AC AA GG TA AA CT AT GA GG C Co mm on T CC AT TT GT TT CA GT TC CC TA A AA CG AG GA TT TC AA GA AA GC AT TC TT CT TT AA CA AG GT AA AC TA TG AG G A C GA AG CG CA AG TT AG GG AA CT GA AA CA AA TG GA TA GC AT AC GC GC AT AT TT SN P A C AA AA FA M C CA CA AC TC AA TA CA AA TC TA GC G HE X GC CA CA AC TC AA TA CA AA TC TA GC T Co mm on C AA AT TT TG TT AG TG TA GA TT TA TC GA G GA AA GA AG GT AA AT AC TT CA AA TT TT GT TA GT GT AG AT TT AT CG AG GG A A C GC TA GA TT TG TA TT GA GT TG TG GC AT TA AA TT TT AG AA GA AC AC AT GA TC NY T 表 C 續(xù) 位 點 編 號 引 物 名 稱 染 色 體 等 位 變 異 等 位 變 異 參 照 品 種 吉 麗 千 禧 引 物 序 列 側(cè) 翼 序 列 SN P G A GG GG FA M C AG CT AA CC AA CC CC TA TG TC A HE X AG CT AA CC AA CC CC TA TG TC G Co mm on A GT TT TA AC GG TA TT CT TA TT GT GT GA AT TT CC TC AG AA TG AC TT CA TG TT GT TC CA GC TA AC CA AC CC CT AT GT C G A A TC AT TC AC AC AA TA A GA AT AC CG TT AA AA CT TT AA AG TT CA AG GA TA GC SN P A G GG AG FA M T TC CA CA AA AC CA CC AT CA AC HE X TT CC AC AA AA CC AC CA TC AA T Co mm on C TA CA AG AC TA TT AA TC AT GT TT TC CT C TT AT AA TC AG TG TA CC CT AC AA GA CT AT TA AT CA TG TT TT CC TC TT TT T A G T TG AT GG TG GT TT TG T GG AA TA AC TT AG TA TT GA CA TT CC TT GG CT AA GA 注 吉 麗 和 千 禧 在 個 SN P 位 點 的 等 位 變 異 信 息 作 為 核 對 每 批 基 因 分 型 數(shù) 據(jù) 質(zhì) 量 的 參 照 樣 品 注 等 位 變 異 為 與 HE X 熒 光 對 應(yīng) 的 變 異 等 位 變 異 為 與 FA M 熒 光 對 應(yīng) 的 變 異 每 個 點 對 應(yīng) 條 引 物 分 別 為 與 FA M 熒 光 H EX 熒 光 對 應(yīng) 的 引 物 以 及 共 用 引 物 采 用 其 他 熒 光 標 記 類 型