侵染假酸漿的泰國番茄黃化曲葉病毒全基因組結構特征.pdf

nullnullnullnullnull nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 收稿日期 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 修訂日期 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 基金項目 null 國家自然科學基金 nullnullnullnull 云南省基礎研究計劃 nullnullnullnullnullnullnullnullnull 云南省農(nóng)業(yè)基礎研究聯(lián)合專項 nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull年 云南省農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新及成果轉化試點專項 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null 通信作者 null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null 為并列第一作者 侵染假酸漿的泰國番茄黃化曲葉病毒 全基因組結構特征 張水英 null null 趙麗玲 null null 鐘 null 靜 null 李婷婷 null 丁 null 銘 null 云南省農(nóng)業(yè)科學院生物技術與種質資源研究所 云南省農(nóng)業(yè)生物技術重點實驗室 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部西南作物 基因資源與種質創(chuàng)制重點實驗室 昆明 nullnullnullnullnullnullnull 摘要 null 為明確假酸漿 nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 葉片黃化 皺縮癥狀是否由菜豆金色花葉病毒屬病毒侵染引起 本研究 利用分子檢測方法和生物信息學技術鑒定了假酸漿樣品中的病毒種類 從采集的病樣中克隆并獲得了 null條菜豆金 色花葉病毒屬病毒 nullnullnull nullnull 全序列和 null條 nullnullnullnull衛(wèi)星全序列 經(jīng)全序列分析發(fā)現(xiàn) 該雙生病毒的兩條 nullnullnull nullnull 全序列 與泰國番茄黃化曲葉病毒 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 云南分離物 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull一 致性最高 達 nullnullnullnullnull 親 緣 關 系 較 近 nullnullnullnull衛(wèi)星的全序列與云南番茄曲葉 nullnullnullnull衛(wèi) 星 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull 的分離物 nullnullnullnullnullnull一致性最高 達 nullnullnullnullnull 親緣關系較近 重組分析顯示 假酸漿上分離的 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull是一個重組病毒 有兩個重組事件 一個主要發(fā)生在 nullnullnull的編碼區(qū) 由中國番茄黃化曲葉 病毒 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 和廣西大戟曲葉病毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull nullnullnullnullnull 重組形成 另一個重組事件主要發(fā)生在基因間隔區(qū) nullnull區(qū) 由泰國煙草卷葉病毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 和 nullnullnullnullnullnullnull重組形成 研究結果表明 假酸漿是 nullnullnullnullnullnullnull的新寄主 這是單組分菜豆 金色花葉病毒屬病毒及其伴隨 nullnullnullnull衛(wèi)星侵染假酸漿的首次報道 關鍵詞 null 假酸漿 null 泰國番茄黃化曲葉病毒 null 基因組特征 null 重組 中圖分類號 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 文獻標識碼 nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null null null nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull 煙粉虱 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 傳播的菜豆金色花葉病 毒屬 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 病毒是雙生病毒科 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull 中種類最多 分布最廣 造成危害最嚴重的一類 病毒 null 按基因組結構分為雙組分病毒和單組分病 毒 雙組分病毒由兩條大小 nullnullnullnullnullnullnullnullnull 的 nullnullnullnull null 和 nullnullnullnullnull 組成 單組分病毒只含有 null 條大小約為 nullnullnullnullnull 的基因組 nullnullnullnullnull 其全基因組含有 null 個 開放閱讀框 正義鏈上的 nullnullnull 和 nullnullnull 基因分別編 碼 nullnull 蛋白和 nullnullnullnullnullnull 蛋白 反義鏈上的 nullnullnull nullnullnull nullnullnull 和 nullnullnull 基因分別編碼 nullnullnull nullnullnullnull nullnullnull 和參與 病毒系統(tǒng)運動的蛋白 null 單組分病毒通常與 nullnullnullnull 衛(wèi)星或與 nullnullnullnull 衛(wèi)星和 nullnullnullnullnull 衛(wèi)星相伴隨復合侵染 植物 nullnullnull nullnullnullnull 衛(wèi)星的基因組 nullnullnullnullnullnullnull 大小約為 nullnullnullnullnullnull 是其輔助的病毒基因組大小的一半左右 nullnullnullnullnullnullnull 保守 區(qū) 含 有 保 守 的 null 堿 基 序 列 nullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 的一個開放閱讀框編碼 null nullnull 蛋 白 null nullnull 蛋白能夠引起典型的病毒侵染癥狀 并能 提高所輔助病毒在寄主植物中的積累量 null nullnullnullnull 年 nullnull 等 null 研究發(fā)現(xiàn) 很多 nullnullnullnull 衛(wèi)星的病毒鏈還可 編碼 null nullnull 蛋白 null nullnull 蛋白有助于病毒的侵染 泰國番 茄 黃 化 曲 葉 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 于 nullnullnullnull 年首次發(fā) 現(xiàn)于泰國田間的番茄上 null 其基因組由兩條大小均 約為 nullnullnullnullnull 的 nullnullnullnullnull 和 nullnullnullnullnull 組成 是一種雙 組分菜豆金色花葉病毒屬病毒 nullnullnullnullnull nullnullnullnull 年 nullnull 等 在云南從表現(xiàn)為卷葉的番茄上發(fā)現(xiàn)的 nullnullnullnullnullnullnull 是單組分病毒 有 null 個樣品還檢測到 nullnullnullnullnullnullnull 序 列 nullnull nullnullnullnull 年 nullnullnull 等首次在臺灣番茄上發(fā)現(xiàn)的 nullnullnullnullnullnullnull 是 雙 組 分 病 毒 但 并 未 發(fā) 現(xiàn) 有 衛(wèi) 星 nullnullnull nullnull nullnullnullnull 年 nullnullnull 等在云南保山番茄上分離到 的 nullnullnullnullnullnullnull 是一種單組分病毒 并伴隨有 nullnullnullnull 衛(wèi) 星 nullnull nullnullnullnull 年 nullnullnullnull 等在臺灣從表現(xiàn)為卷葉 小泡 畸 形 葉脈黃化和萎縮的辣椒上首次發(fā)現(xiàn)的 nullnullnullnullnullnullnull 是雙組分病毒 但并未檢測到 nullnullnullnullnullnullnull nullnull 假酸 漿 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull 又名大千生 田珠 冰粉 水晶涼粉 藍花天仙子 鞭 打繡球等 屬茄科 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 假酸漿屬 nullnullnullnullnullnullnullnull 假酸漿原產(chǎn)于南美洲 在我國作為藥用或觀賞植物 栽培 四川 云南 廣西等地均有分布 生于田邊 荒 地 籬笆邊 屋院周圍 其全草可藥用 有鎮(zhèn)靜 祛痰 清熱解毒之效 nullnull 目前假酸漿上報道的病毒有番 茄 嚴 重 皺 紋 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnull 馬 鈴 薯 null 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull nullnull 和 苜 蓿 花 葉 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull nullnull 還未見其他病毒的報道 本研究采集了 表現(xiàn)葉片黃化和皺縮的假酸漿病株 從中分離 鑒定 出了菜豆金色花葉病毒屬病毒 并對分離到的病毒 核苷酸序列進行了比對和進化重組分析 nullnull 材料與方法 nullnullnullnull 樣品采集和 nullnullnull 提取 nullnullnullnull 年 null 月 在保山隴川縣戶撒阿昌族鄉(xiāng)對田 間雙生病毒病害進行調查時發(fā)現(xiàn) 田間部分假酸漿 植株表現(xiàn)出葉片黃化 皺縮等疑似雙生病毒侵染引 起的典型癥狀 圖 null 隨機采集病株的葉片編號為 nullnullnullnullnullnull 采 用 nullnullnullnull 法 nullnull 提 取 病 株 葉 片 的 總 nullnullnull 圖 null null 田間表現(xiàn)為黃化 皺縮癥狀的假酸漿植株 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnull 假酸漿病樣的 nullnullnull 檢測 為了檢測病葉中是否含有菜豆金色花葉病毒屬 病毒 分別利用該屬病毒 nullnullnullnullnull 基因組部分序列 的通 用 簡 并 引 物 nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull 以 及 nullnullnullnullnull 通用簡并引物 nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnull 對假酸 漿總 nullnullnull 進行 nullnullnull 檢測 同時利用 nullnullnullnull 和 nullnullnullnullnull 衛(wèi) 星 nullnullnull 通 用 引 物 null nullnull null nullnull nullnull 和 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnull 表 null 分別檢測是否含有病毒伴隨的衛(wèi) 星 nullnullnull nullnullnull nullnull卷第 null期 張水英等 侵染假酸漿的泰國番茄黃化曲葉病毒全基因組結構特征 表 null null 本研究所用到的引物及其序列 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 引物 nullnullnullnullnullnull 引物序列 nullnull nullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 目的片段長度 null null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 目的 nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnull擴增 nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnul